工業電腦在進行EMC設計時，最先考慮的是板卡自身的EMI（電磁干擾）設計。同時，工業電腦的使用環境較為復雜，除了考慮工業電腦自身的電磁輻射干擾外，防止外界因素對工業電腦造成干擾也是EMC設計要點。即工業電腦的EMC設計則是雙向的。

1、工業電腦散熱口的EMC設計

無論對內還是對外，處理電磁輻射最好的方法就是用一個全密封的金屬盒子把電磁輻射體遮蔽起來。而由于散熱、外接擴展設備的因素，工業電腦無法做到嚴格密封的狀態。要求散熱和電磁泄漏之間達到良好平衡性設計。實驗表明，方形散熱口要比圓形散熱口具有更出色的防止電磁泄漏效果。

2、機箱接縫處的EMC設計

根據理論，當工業電腦機箱上兩個接觸點之間的距離大于一定值時，兩點之間就可能泄漏出電磁輻射。因此機箱接縫處的設計，也是驗證EMC設計的一個重要指標。

工業電腦機箱采用的材料為優質鋁合金，本身具有優秀的抗形變特性，且工業電腦機箱多為臥式，頂部鋼板自身的重量和鋼材特性已經能夠保證機箱壁之間的嚴密接觸。

此外，板卡和機箱的接縫處，也是極其容易引起電磁泄漏的地方。工業電腦內部會插入多塊板卡，板卡和機箱的接觸嚴密與否是電磁兼容是否優秀的一個重要指標，因此做工優良的工業電腦會采用EMI彈片確保板卡和機箱之間的接縫緊密可靠。

3、機箱表面的特殊設計

首先，工業電腦用在有強烈腐蝕性的環境時，如海上，機箱內外表面都必須要做抗腐蝕處理。

其次，工業電腦在振動環境下，會導致機箱內的某些電器元件接觸到機箱內部表面，要求工業電腦在內部做噴漆處理使得機箱內壁不導電，以免造成短路，燒毀設備。

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